南方水产科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:44-1683/S

国际刊号:2095-0780

南方水产科学杂志2020年第5期:基于线粒体Cytb基因序列的西江流域广西境内卷口鱼遗传多样性分析

发布日期:

作者:彭敏, 韩耀全, 王大鹏, 施军, 吴伟军, 李育森, 雷建军, 何安尤

关键词:卷口鱼, 遗传分化, 遗传多样性, <i>Cytb</i>基因, 西江流域

为了解西江流域广西境内卷口鱼 (Ptychidio jordani) 种群遗传结构及分化程度,采用线粒体Cytb基因序列对西江流域广西境内6个江段的139尾野生卷口鱼的遗传多样性进行了分析。结果显示,线粒体Cytb基因长度为1 053 bp,碱基T、C、A、G的平均含量分别为29.1%、27.7%、29.3%、13.9%,其中A+T (58.4%) 高于C+G (41.6%)。共定义20个单倍型,并聚为2个分支,未观察到明显的地理聚群。6个卷口鱼群体的平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性分别为0.7682、0.0023,其中红水河群体 (单倍型多样性h=0.748 7,核苷酸多样性π=0.003 3) 遗传多样性最高,柳江群体 (h=0.274 4, π=0.000 4) 和左江群体 (h=0.3747, π=0.000 3) 的遗传多样性相对较低。卷口鱼总体的遗传分化指数 (FST) 为0.461 4 (P&lt;0.01),表现出较大的遗传分化。两两群体间遗传分化结果显示,左江和柳江种群之间的遗传分化程度最大,而柳江和西江之间最小。AMOVA分析表明西江流域的卷口鱼群体遗传变异一半来自群体内 (53.86%),一半来自群体间 (46.14%)。中性检验 (Tajima&#39;s D=−1.082 8, P&gt;0.05;Fu&#39;s Fs=−6.572 5, 0.01&lt;P&lt;0.05) 与碱基错配分布分析表明西江流域卷口鱼种群大约在0.07~0.187 Ma经历了种群扩张。综上,西江流域广西境内的卷口鱼柳江群体和左江群体遗传多样性较低,总群体分化程度较大,但仍属于一个种群,其中空间距离与地理阻隔对卷口鱼的遗传分化具有一定的促进作用。

来源:2020年第5期

《南方水产科学》期刊编辑部

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