南方水产科学杂志

南方水产科学杂志2025年第4期

  • 新型裂解性副溶血弧菌噬菌体vB_VpS_BA27的特性及基因组研究
    张悦, 赖晓芳, 刘畅, 刘广锋, 江丽玲, 张洪赛, 李梦瑶, 王杏, 姜敬哲
    噬菌体作为一种特异性感染并裂解细菌的病毒,在细菌性疾病防控和环境微生物治理领域具有重要应用价值。副溶血弧菌 (Vibrio parahaemolyticus) 是水产养殖中的常见致病菌,常导致水生动物病害并引发人类食源性疾病。从湛江东海岛方斑东风螺 (Babylonia areolata) 养殖厂的病螺池水样中分离出1株副溶血弧菌噬菌体 (vB_VpS_BA27),并对其生物学特性和基因组特征进行了系统研究。结果显示,vB_VpS_BA27在较宽的pH范围 (3~11) 内保持活性,且在低温环境 (4~37 ℃) 下生存能力较强。vB_VpS_BA27表现出显著的抑菌活性,其爆发量可达285.67 PFU·细胞−1。基因组测序分析证实vB_VpS_BA27为裂解性噬菌体,基因组中未检测出耐药基因和毒力因子。系统发育分析显示,在有尾噬菌体纲 (Caudoviricetes) 中,vB_VpS_BA27与Delepquintavirus的亲缘关系较近,并与若干相关噬菌体共同形成了一个新的类别。研究表明,vB_VpS_BA27噬菌体在方斑东风螺弧菌性疾病的防控方面具有良好的应用潜力,为水产养殖病害的生物防控提供了新思路。
  • 基于RPA-CRISPR/Cas12a的神经坏死病毒快速检测方法建立
    闫光达, 马红玲, 徐力文, 邓益琴, 郭志勋, 冯娟
    赤点石斑鱼神经坏死病毒 (Red spotted grouper nervous necrosis virus, RGNNV) 是危害中国海水养殖鱼类的主要病原体之一,尽早检出RGNNV是防控该病毒感染和减少养殖损失的关键措施。为建立快速检测RGNNV的方法,将重组酶聚合酶扩增 (Recombinase polymerase amplification, RPA) 技术与CRISPR/Cas12a (CRISPR,成簇规律间隔短回文重复序列;Cas12a,CRISPR相关蛋白) 检测系统相结合,通过设计和筛选RPA引物与crRNA (CRISPR RNA),优化RPA反应条件与CRISPR/Cas12a检测体系,评估该方法的灵敏度与特异性。同时,对临床石斑鱼样本进行检测,并与行业标准《SC/T 7216—2022 鱼类病毒性神经坏死病诊断方法》中规定的qPCR法进行一致性比较。结果显示,该检测方法最短可在45 min内得到结果,灵敏度为1.5×101 拷贝·µL−1,检测特异性良好,实际样本检测与行标qPCR法对比符合率为100%。研究建立的RPA-CRISPR/Cas12a-RGNNV检测方法具有快速、便捷、高灵敏度、强特异性和可视化检测结果等特点,为RGNNV的现场快速检测提供了新的技术手段。
  • 一株鲈鱼源致病性鰤鱼诺卡氏菌XXLX2的分离鉴定及比较基因组分析
    刘宸源, 尚钰坤, 毛会丽, 李赛博, 王乾坤, 张荇荇, 朱黎星, 张子怡, 申长春, 关建义
    分离、鉴定河南新乡某养殖场大口黑鲈 (Micropterus salmoides) 患病的病原菌,了解分离菌致病性,结合耐药基因注释分析药敏结果,对其基因组结构、毒力因子与近缘菌株进行比较分析,以期寻找共同的免疫保护抗原功能基因。结合菌落形态特征、理化特性分析,并基于16S rRNA基因序列比对鉴定分离菌,对其进行溶血试验、人工回归感染试验、药敏试验及全基因组测序分析。分离菌XXLX2鉴定为鰤鱼诺卡氏菌 (Nocardia seriolae),其在血平板上无溶血圈现象,经回归感染试验计算出其对大口黑鲈的半数致死量 (LD50) 为1.49×105 CFU·mL−1,且被感染鱼与自然患病鱼的症状相符。XXLX2菌株对多黏菌素B、红霉素和β-内酰胺类抗生素显示出抗性,耐药基因和药敏试验结果基本一致。通过基因组比较分析,XXLX2菌株与EM150506、NK201610020和UTF1等3株不同来源的鰤鱼诺卡氏菌具有较近的亲缘关系,且具有较好的共线性;XXLX2菌株与3株鰤鱼诺卡氏菌在毒力因子的比对中存在一定差异,但整体具有较高的保守性。通过对XXLX2菌株进行基因组注释与比较分析,为进一步探索鰤鱼诺卡氏菌致病机制及基因工程疫苗研究提供了基础数据支撑。
  • 弗氏柠檬酸杆菌噬菌体NM4.3生物学特性及全基因组分析
    陈煜裕, 刘畅, 魏永谦, 刘春, 姜敬哲
    弗氏柠檬酸杆菌 (Citrobacter freundii) 是近年来牛蛙 (Rana catesbeiana) 养殖中新出现的高致病性病原菌,其多重耐药性增加了防控难度。从牛蛙养殖尾水中分离出1株裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体NM4.3,通过全基因组测序、生物学特性和系统发育分析,评估其潜在应用价值。结果显示,NM4.3为圆环dsDNA噬菌体,基因组大小为174 351 bp,GC含量为38.74%,编码310个开放阅读框 (ORF),包含病毒粒子结构、宿主裂解及DNA代谢相关功能基因,还额外编码13个tRNA。生物学特性结果表明,NM4.3潜伏期短 (10 min),裂解效率高 (爆发量76 PFU·细胞−1),在60 ℃和pH 3~12处理1 h后仍可维持一定活性。基于基因组的核酸序列和保守基因末端酶大亚基 (Ter-L) 的氨基酸序列分析,鉴定NM4.3属于Straboviridae、Tevenvirinae、Moonvirus,与已知成员的平均核苷酸一致性 (ANI) 低于95%,定义为该属下的一个新种。基因组注释发现其长尾纤维蛋白存在变异,这可能是影响宿主特异性的因素。
  • CMSY模型参数敏感性分析:以西印度洋重要鱼类种群为例
    葛春银, 李增光, 万荣, 吴子健, 刘瀚丹, 赵瑞, 游鹏
    渔业资源可持续利用亟需有效的评估方法。传统评估方法因数据需求量大而受限,促使数据有限的评估方法迅速发展。其中,仅需捕捞数据的蒙特卡洛模拟捕捞量-最大可持续产量 (Monte Carlo Catch-MSY, CMSY) 模型应用广泛,但其参数设定可能影响结果可靠性。文章以西印度洋15 种主要经济鱼类种群为例,开展CMSY模型的参数敏感性分析,并评估其资源状况。结果表明,不同鱼类种群对模型参数 (Bend/k,相对生物量) 变化的响应存在差异,其中云鲥 (Tenualosa ilisha) 和剑鱼 (Xiphias gladius) 最为显著。除了龙头鱼 (Harpadon nehereus)、乳香鱼 (Lactarius lactarius) 和大眼金枪鱼 (Thunnus obesus) 外,大部分鱼类种群资源状况均处于捕捞型过度捕捞和资源型过度捕捞状态。与以往研究相比,中上层鱼类与中下层鱼类的CMSY模型结果基本一致;而金枪鱼类的评估结果则与印度洋金枪鱼委员会 (Indian Ocean Tuna Commission, IOTC) 基于数据充足方法的结论有较大差异。这表明CMSY模型在金枪鱼类资源评估中具有较高的不确定性,但对中上层小型鱼类和中下层鱼则表现出较好的适用性和可靠性。
  • 东太平洋延绳钓渔业兼捕鲨鱼物种的生态风险评估
    李娜, 林琴琴, 朱江峰
    东太平洋是全球金枪鱼渔业的主要作业海域,其延绳钓渔业对兼捕鲨鱼种群的影响一直受到国际社会的高度关注。基于生产力-易损性分析 (Productivity-susceptibility analysis, PSA) 方法,对东太平洋延绳钓渔业兼捕的8种鲨鱼进行生态风险评估,并对PSA所采用的属性进行敏感性分析。结果显示:鲨鱼种群的生产力指数介于1.40~2.20,最高为黑边鳍真鲨 (Carcharhinus limbatus);易损性指数介于2.17~2.83,最高为尖吻鲭鲨 (Isurus oxyrinchus);脆弱性分数介于1.55~2.31,最高为大眼长尾鲨 (Alopias superciliosus)。生态风险评估表明,长鳍真鲨 (C. longimanus)、尖吻鲭鲨和大眼长尾鲨处于高风险状态,黑边鳍真鲨、镰状真鲨 (C. falciformis)、大青鲨 (Prionace glauca)、长鳍鲭鲨 (I. paucus) 和路氏双髻鲨 (Sphyrna lewini) 处于中风险状态。此外,敏感性分析结果显示,繁殖策略、种群水平重叠度和集群行为这3个属性对种群脆弱性评价结果影响最大,其移除后的均方根误差值 (Root mean squared error, RMSE) 分别为0.210 1、0.128 8和0.090 1。综上,长鳍真鲨、尖吻鲭鲨和大眼长尾鲨为东太平洋海域需优先关注的物种,建议加强数据收集、种群评估及管理措施,以降低渔业活动对其种群的影响。
  • 基于最大熵模型的长江口三类生态型仔稚鱼生境分布特征
    吴子健, 李增光, 万荣, 王嘉洛, 葛春银, 王大元, 赵欣
    为解析长江口洄游性、海洋性与河口性三类仔稚鱼生境分布的环境驱动因子,根据2022年9月 (夏季)、2023年4月 (春季) 长江口仔稚鱼采样数据,采用最大熵 (Maximum entropy, MaxEnt)模型分析凤鲚 (Coilia mystus,洄游性)、鳀 (Engraulis japonicus,海洋性) 和香䲗 (Callionymus olidus,河口性) 的生境分布特征及其环境驱动机制。结果表明,长江口南支的海表面温度、pH、营养盐高于北支,而北支的海表面盐度、叶绿素高于南支;MaxEnt模型对这3种仔稚鱼生境分布具有较强的预测能力 曲线下面积 (Area under the curve, AUC)>0.8,且春季略优于夏季;影响凤鲚和香䲗春、夏季生境分布的关键因子均为海表面溶解氧 (相对贡献率分别为80.8%、86.6%和39.8%、30.2%),而鳀为海表面盐度 (分别为44.0%和79.0%)。不同生态类型仔稚鱼的生境特征及其关键环境因子存在显著差异,导致其早期生活史阶段的补充过程对环境变化的响应呈现种间特异性。因此,长江口仔稚鱼资源的保护需针对不同生态类型鱼类的生物学特性及栖息地需求,制定差异化的保护策略。
  • 基于茎柔鱼胃含物分析的东南太平洋饵料生物多样性研究
    李露, 林东明
    生物多样性是维持生态系统稳定性的重要基础,而海洋生物多样性的长期动态监测面临挑战。为探究东南太平洋鱿钓渔场的生物多样性特征,以茎柔鱼 (Dosidicus gigas) 作为生物采集器,调查了该海域生物多样性的时空分布,并采用广义相加混合效应模型 (Generalized Additive Mixed-Effects Models, GAMMs) 分析了生物多样性指数与环境因子的相关性。结果显示:120个胃样本中共鉴定出43个物种,其中辐鳍鱼纲27种,头足纲8种,腹足纲7种,软甲纲1种。生物多样性指数呈显著的空间分布差异,Margalef和Shannon-Wiener指数均呈从大洋海域向近海海域递增的趋势;生物多样性指数季节性差异虽不显著,但春季生物多样性指数相对较高;生物多样性指数与叶绿素a浓度呈显著负相关,与海平面高度和净初级生产力呈正相关,而与海表温度无显著关联。研究表明,东南太平洋鱿钓渔场生物多样性具有明显的空间分布规律,季节间相对稳定,其时空分布差异是生境异质性和海域环境动态变化的结果。
  • 基于线粒体COI和18S rRNA基因构建舟山海域浮游动物DNA宏条形码数据库
    冼华琳, 汤昌盛, 张杨阳, 张晓林, 廖智, 周钰琴, 谢舒烨, 严小军
    为构建舟山海域浮游动物本地条形码数据库,从而为该海域浮游动物的种类鉴定、系统进化关系及种群遗传学研究提供科学依据。基于过去14年的文献报道,编制了收录23目64科96属155种浮游动物的舟山海域浮游动物物种名录,通过从NCBI GenBank参考数据库获取相关数据,共收集浮游动物线粒体COI基因序列195条和核糖体18S rRNA基因序列134条,初步建立了舟山海域浮游动物条形码数据库。对最优势类群桡足类进行了种间和种内遗传距离的计算分析。结果显示:桡足类COI基因序列种间平均遗传距离为0.313 6,是种内平均遗传距离的34.09倍;18S rRNA基因序列的种间平均遗传距离为0.262 8,是种内平均遗传距离的26.82倍。COI基因序列的种间和种内遗传距离存在明显的条形码间隔,而18S rRNA基因序列的种间和种内遗传距离存在重叠,没有明显的条形码间隔。基于COI和18S rRNA基因序列构建的系统发育树表明,2种条形码基因在目和科水平上均能有效区分不同的浮游动物类群。舟山海域浮游动物DNA宏条形码数据库的建立,有利于浮游动物种类鉴定及多样性评估,并为该海域海洋生态环境状况评价提供科学依据。
  • 气候变化下中国罗非鱼潜在入侵区预测
    陈灵芝, 钟亚娜, 冯程, 颜云榕
    罗非鱼作为中国引入的重要经济鱼类,具有较强的环境适应和资源利用能力。其入侵潜力对本土生态系统造成了严重负面影响,而未来气候变化的不确定性进一步增加了罗非鱼入侵防治工作的复杂性。选取中国华南地区广泛分布的3种罗非鱼−尼罗罗非鱼 (Oreochromis niloticus)、莫桑比克罗非鱼 (O. mossambicus) 及齐氏罗非鱼 (Coptodonzillii),结合MaxEnt模型与CMIP6气候模型数据,对3种时间跨度 (当前、2041—2060年、2081—2100年) 和4种情景 (SSP126、SSP245、SSP370、SSP585) 下罗非鱼的潜在入侵区域进行了预测。结果表明:1) 广东和广西是罗非鱼入侵治理的重点区域;2) 未来罗非鱼潜在高风险入侵区面积有增加的趋势;3) 罗非鱼潜在高风险入侵区有向高纬度迁移的趋势;4) 冬季温度和降水的协同作用是导致罗非鱼高风险入侵区面积扩增的主要环境驱动因素。
  • 基于机器视觉的凡纳滨对虾生物量参数估计
    朱元昆, 赵爽, 苗玉彬
    针对凡纳滨对虾 (Litopenaeus vannamei) 养殖过程中,传统生物量人工监测效率低、应激损伤大等问题,研究提出了一种融合改进YOLOv8算法与最小包围盒 (Oriented Bounding Box, OBB) 的非接触式体长-体质量估算方法,以提升智能化投饲管理的效率和准确性。该方法通过以下技术改进实现生物量参数的有效估计:首先,融合Focal-GIoU构建损失函数,增强对遮挡虾体的检测能力;其次,引入GhostNetV2轻量化网络的空间-通道解耦注意力机制,提升特征表达能力,并集成RepBlock动态可重构模块,增强多尺度形态自适应识别能力;最后,提出基于主成分分析的最小包围盒 (Principal Components Analysis-Oriented Bounding Box, PCA-OBB) 算法,通过协方差矩阵特征分解确定虾体主轴方向,并结合霍夫圆检测标定像素-物理尺寸转换系数,建立体长-体质量回归模型。结果表明,该方法对120日龄凡纳滨对虾体长的测量平均相对误差为1.26%,最大绝对误差为0.503 cm,体质量预测平均相对误差为5.3%,均优于传统人工测量。该方法实现了凡纳滨对虾的非接触式生物量参数实时监测和估计,为精准投喂提供了有效技术支持。
  • 基于Cyt b基因序列的黄斑蓝子鱼群体遗传多样性分析
    郑鹏, 李文俊, 陈锭娴, 黄小林, 王凯丰, 刘兰苑, 韩崇, 李强, 杨育凯, 黄忠
    黄斑蓝子鱼 (Siganus oramin) 养殖群体已出现经济性状衰退和遗传多样性下降问题。为保护野生种质资源,对采自中国东南沿海7个地理群体 (湛江北部湾BB、海南文昌WC、阳江沙扒湾SB、深圳大鹏湾DP、深圳大亚湾DY、漳州东山湾DS和宁德三沙湾SS)的197尾样本进行线粒体Cyt b基因测序分析,旨在评估野生群体的遗传多样性状况。结果显示,黄斑蓝子鱼的线粒体Cyt b基因全序列长度为1 141 bp,包含140个变异位点,81个单倍型,表现出高单倍型多样性 (Hd=0.921±0.014) 和低核苷酸多样性 (Pi=0.006 4±0.001 0) 的特点。遗传距离和遗传分化结果均显示黄斑蓝子鱼群体间未发生明显分化,各地理群体亲缘关系较近。基于Cyt b基因序列构建的NJ树显示,81个单倍型散落分布在一个支系,各群体均未形成明显单系群。单倍型网络分析结果亦表明不同地理区的黄斑蓝子鱼群体间未发生明显分化。AMOVA分析表明,黄斑蓝子鱼遗传分化主要来自群体内部 (99.83%)。中性检验结果显示,Fu's Fs值为显著的负值 (−24.605, p<0.05);贝叶斯天际线图表明黄斑蓝子鱼短时间内经历了瓶颈效应以及种群扩张事件,推测其扩张时间约为1.577万年前。
  • 镉胁迫对罗氏沼虾幼苗肠道菌群的影响
    包松松, 高强, 程海华, 彭菲, 阳志文, 范广, 周攀
    镉 (Cd) 作为一种毒性强、难降解且易蓄积的重金属,已成为养殖水域中最主要的重金属污染物之一。为探究重金属污染对虾类早期发育阶段的毒性效应,开展了镉胁迫对罗氏沼虾 (Macrobrachium rosenbergii) 幼苗肠道微生物群落结构及功能影响的研究。将罗氏沼虾幼苗均匀分为对照组 (C0:0 mg·L−1) 和镉处理组 (C1:0.1×10−4 mg·L−1,C2:0.3×10−4 mg·L−1,C3:0.5×10−4 mg·L−1和C4:0.7×10−4 mg·L−1),养殖42 d。结果显示,与对照组相比,镉处理组的操作分类单元 (Operational taxonomic unit, OTU) 数量增加,且C4组的ACE和Chao1指数显著升高 (p<0.05)。在门水平上C0—C4组的优势菌群是厚壁菌门、变形菌门和放线菌门,属水平上C0—C4组的优势菌群是乳球菌属 (Lactococcus)。同时,门水平上C4组的拟杆菌门、髌骨细菌门等差异显著 (p<0.05),属水平上C4组的假黄单胞菌属 (Pseudoxanthomonas)、生孢噬胞菌属 (Sporocytophaga) 等差异显著 (p<0.05)。通过LEfSe分析,在5个组中共鉴定出51个具有显著差异的标志性物种。KEGG分析结果显示,镉胁迫下肠道菌群的功能主要富集于新陈代谢相关通路,包括碳水化合物代谢、氨基酸代谢和能量代谢等。研究表明,镉胁迫改变了罗氏沼虾幼苗肠道菌群的结构和功能,有助于进一步优化养殖模式,减少镉污染带来的损失,保障罗氏沼虾养殖产业的稳定发展。
  • 半褶织纹螺体内的河豚毒素及菌群结构分析
    陈小红, 沈晓娜, 许贻斌, 许翠娅, 郑惠东
    河豚毒素 (Tetrodotoxin, TTX) 是一种强毒性生物毒素,在自然界中分布较广。为探究半褶织纹螺 (Nassarius semiplicatus) 体内TTX的可能细菌性来源,采用液相色谱-串联质谱法分析福建海域半褶织纹螺体内的TTX及同系物,并利用高通量测序分析含和不含TTX的织纹螺的细菌群落结构。结果显示,含TTX织纹螺组 (LTN组) 中TTX的质量分数为402~644 μg·kg−1,同时检测到trideoxyTTX、dideoxyTTX、deoxyTTX等3种同系物;不含TTX织纹螺组 (NTN组) 检测到微量的dideoxyTTX。高通量测序结果显示,LTN组的群落丰富度显著高于NTN组 (p<0.05);2组的主要优势菌门为变形菌门;LTN组的主要优势菌属包含弧菌属 (Vibrio)、假交替单胞菌属 (Pseudoalteromonas)、嗜冷杆菌属 (Psychrobacter) 等产TTX相关菌,NTN组包含假交替单胞菌属、希瓦氏菌属 (Shewanella)。弧菌属、嗜冷杆菌属等17个差异菌属在LTN组中的相对丰度大于NTN组 (p<0.05)。2组的菌群KEGG功能组成相似,以氨基酸代谢、碳水化合物代谢等为主。结果表明,含或不含TTX的半褶织纹螺均存在产TTX相关菌,弧菌属、嗜冷杆菌属更容易在含TTX半褶织纹螺中富集,这些菌属可能与半褶织纹螺体内TTX同系物或前体物质的生物合成有关。
  • 运输密度对多纹钱蝶鱼肝脏抗氧化指标及基因转录的影响
    高进, 柯宏基, 张一冰, 陈傅晓, 王永波, 符书源, 刘龙龙, 谭围
    运输密度是影响鱼类水质条件、应激水平和存活率的重要因素。为探究不同运输密度条件下多纹钱蝶鱼 (Selenotoca multifasciata) 肝脏组织的抗氧化酶活性及转录表达差异,基于车载运输的多纹钱蝶鱼数量设置4个车载运输组 (G3.5K、G5K、G6.5K和G8K) 和运输前对照组 (G0K),分别测定实验鱼的存活率、水质及肝脏组织抗氧化酶活性等指标,并取G3.5K和G8K实验组的肝脏组织进行转录组测序分析。结果显示,多纹钱蝶鱼鱼苗死亡率随运输密度和运输时间的增加而升高,4个运输组实验鱼3 h内存活率分别为100%、99.34%、97.80%和94.50%;水质指标氨氮、非离子氨、亚硝酸盐和浊度亦随运输时间的增加而升高,pH却呈相反的变化趋势。抗氧化指标超氧化物歧化酶 (SOD) 和过氧化氢酶 (CAT) 活性随运输密度的增加呈先升高后降低的变化趋势;丙二醛 (MDA) 含量则随运输密度的增加而升高。转录组基因差异表达分析共筛选到3 804个差异表达基因 (DEGs),其中上调和下调表达的DEGs数分别为2 389和1 415;GO和KEGG富集分析表明多数DEGs参与了mRNA分解代谢、氧化磷酸化和泛素介导蛋白质降解等生物学过程和通路。在多纹钱蝶鱼鱼苗循环水运输过程中,建议鱼苗运输密度宜控制在12 kg·m−3以内。
  • 中国大陆裸胸鳝属鱼类新记录种—杂色裸胸鳝形态与线粒体基因组分析
    程静, 李庚锋, 莫德鑫, 胡凯红, 郜梓涵, 李丰, 梁日深
    目前全球裸胸鳝属 (Gymnothorax) 鱼类的种质资源研究仍存在较大空白,其物种分类与资源信息亟待修订与更新。通过形态学与分子生物学方法,对广东省湛江海域采集的裸胸鳝属鱼类样本进行鉴定,以期为该属种质资源分析与物种名录更新提供科学依据。以采集的1尾裸胸鳝属鱼类样本为研究对象,结合外部形态特征分析和线粒体全基因组测序技术进行物种鉴定。形态学数据显示,该样本体色呈单一褐色,无斑纹或斑点,背鳍较高,起源于鳃孔之前,各鳍边缘呈淡灰色,下颌微弓,嘴巴不能完全闭合,齿单列,椎骨式为5-58-140,与文献记载的新种杂色裸胸鳝 (G. poikilospilus sp. nov.) 形态数据基本吻合。线粒体基因组全长16 572 bp,包含22个tRNA、2个rRNA、13个蛋白编码基因及1个非编码区,基因数量与排列特征与其他鱼类相似。系统发育分析表明,杂色裸胸鳝与奥迪萨裸胸鳝 (G. odishi)、匀斑裸胸鳝 (G. reevesii) 及淡网纹裸胸鳝 (G. pseudothyrsoideus) 亲缘关系较近,且基于COI基因的进化树中,该样本与杂色裸胸鳝聚为一支。遗传距离分析显示,两者遗传距离仅为0.004,显著低于物种鉴定阈值 (0.020),进一步支持其分类地位。综合形态学与分子生物学证据,首次确认该杂色裸胸鳝为中国大陆裸胸鳝属新记录种,可为完善该属种质资源数据库及后续分类研究提供重要参考。
  • 杉虎杂交斑肌球蛋白重链基因分子结构分析及生长相关SNPs筛选
    曹柳, 马军, 卢艳, 武雅彤, 王钧, 钟立静, 苏珊珊, 黄海
    肌球蛋白重链 (Myosin heavy chain) 参与鱼类肌纤维肥大和增生过程,在肌肉生长和收缩过程中扮演重要角色。为筛选出与生长性状相关的单核苷酸多态性 (Single nucleotide polymorphisms, SNPs) 位点,采用PCR扩增技术获得海水经济养殖鱼类——杉虎杂交斑 (棕点石斑鱼Epinephelus fuscoguttatus ♀ × 清水石斑鱼E. polyphekadion ♂) 的肌球蛋白重链基因序列全长,并基于相关性分析筛选与生长性状相关的SNPs位点。结果表明,杉虎杂交斑肌球蛋白重链基因序列全长为12 129 bp,包含36个外显子和35个内含子,可编码1 934个氨基酸。该基因包含4种类型的蛋白结构域:Myosin_N、MYSc、IQ和Myosin_tail_1。经比对分析发现,该基因的核苷酸序列及蛋白结构域在鲈形目、鲀形目和鲽形目鱼类中均表现出较高的保守性。在肌球蛋白重链基因中检测到62个SNPs位点,其中8个符合Hardy-Weinberg平衡。有12个SNPs位点位于外显子区域,且均与体质量、全长等多个生长表型性状显著相关 (p<0.05)。在这12个SNPs位点中仅有g5417 C>G为错义突变,导致丙氨酸变成甘氨酸;其余位点均为同义突变。这些与生长相关的SNPs位点可作为杉虎杂交斑生长分子标记开发的候选位点。
  • 麦瑞加拉鲮胚胎及仔鱼发育研究
    甘星, 杨洋, 王岳松, 钟天, 丁慧萍, 张志明
    麦瑞加拉鲮 (Cirrhinus mrigala) 是华南地区重要养殖品种。为补充该物种的基础生物学数据,并为其苗种规模化培育和增养殖产业的可持续发展提供科学依据,通过人工授精获得其受精卵,详细观察并记录其胚胎及仔鱼的发育过程。结果显示,麦瑞加拉鲮产漂流性卵,成熟卵子直径为 (1.41±0.08) mm,受精卵呈圆球形、淡灰色,吸水膨胀后直径达 (4.98±0.67) mm,膨胀系数为353.19%。在水温26~28 ℃下,整个胚胎发育过程历时15 h 40 min,所需积温438.67 ℃·h。历经胚盘形成期、卵裂期、囊胚期、原肠期、神经胚期、器官形成期和孵化期共7个阶段、32个时期。初孵仔鱼全长 (4.51±0.19) mm,1日龄生长速率最大,绝对生长率 (Absolute growth rate, AGR) 和特定生长率 (Specific growth rate, SGR) 分别为1.75 mm·d−1和32.87%·d−1。出膜后41 h进入混合营养期,4日龄进入外源性营养期,9日龄进入稚鱼期。
  • 基于非靶向代谢组学分析蚝油变质过程中代谢产物差异
    赵阳, 邓建朝, 张思蓉, 李春生, 相欢, 王迪, 赵永强, 陈胜军
    开盖后的蚝油在常温条件下容易受到谢瓦曲霉 (Aspergillus chevalieri) 的污染而发生变质。为探究蚝油霉变的详细过程,对模拟变质的蚝油样品的基本理化指标进行测定,并结合非靶向代谢组学方法,分析蚝油变质过程中代谢物的差异及变化规律。结果表明,变质过程中的蚝油总蛋白酶活性、α-淀粉酶活性、水分、总酸和挥发性盐基氮等呈上升趋势,而糖类、蛋白质和总游离氨基酸含量则呈下降趋势。从蚝油样品中共鉴定出618种代谢物,主要分为脂类和类似脂类分子、有机酸及其衍生物、有机氧化合物及有机杂环化合物等14类。使用正交偏最小二乘判别分析 (Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis, OPLS-DA) 模型筛选显著差异代谢物,筛选标准为:变量重要性投影 (Variable importance in the projection, VIP) 值≥1,p<0.05,且差异倍数 (Fold change, FC) 需满足 >2或 <1/2,在该条件下共筛选出21种差异代谢物,其中上调代谢物有10种,下调代谢物有11种。京都基因与基因组百科全书 (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG) 通路富集分析表明,差异代谢物主要参与淀粉和蔗糖代谢、脂质代谢、赖氨酸降解、核苷酸代谢等相关通路,这说明蚝油变质过程中各营养物质的消耗均有差异。
  • 斑鳠、大鳍鳠、越鳠肌肉的营养成分分析及品质评价
    陈峰, 李光略, 陈燕芸, 吴雪萍, 朱佳杰
    为探究斑鳠 (Hemibagrus guttatus)、大鳍鳠 (H. macropterus) 和越鳠 (H. pluriradiatus) 的肌肉营养成分和品质差异,采用生化分析方法对3种鱼类背部肌肉中的一般营养成分含量以及氨基酸、脂肪酸和矿物元素的组成与含量进行测定和评价。结果显示,斑鳠的水分含量显著高于大鳍鳠和越鳠 (p<0.05);越鳠和大鳍鳠的蛋白质含量显著高于斑鳠 (p<0.05);粗脂肪和总糖含量从高到低依次为越鳠、大鳍鳠、斑鳠,且差异显著 (p<0.05);灰分含量则无显著差异 (p>0.05)。3种鱼类均检出16种常见氨基酸,其中以谷氨酸含量最高;必需氨基酸 (Essential amino acids, EAA) 中以赖氨酸含量最高。总氨基酸含量 (Total amino acids, TAA) 和必需氨基酸指数 (Essential amino acid index, EAAI) 均以斑鳠最低,越鳠最高。氨基酸评分 (Amino acid score, AAS) 与化学评分 (Chemical score, CS) 显示,3种鱼类的第一限制氨基酸均为甲硫氨酸+半胱氨酸。3种鱼类共检出24种脂肪酸,其中斑鳠的多不饱和脂肪酸含量最高,且均以n-6系列的C18:2n6c (亚油酸) 为主。斑鳠的致动脉粥样硬化指数 (Atherogenic index, AI=0.47) 和血栓形成指数 (Thrombosis index, TI=1.21) 最低。3种鱼类肌肉中富含多种无机元素:常量元素以钾 (K) 含量最高,呈现“高钾低钠”的特征;微量元素中铁 (Fe)、锌 (Zn)、硼 (B) 含量较高;硒 (Se) 仅在越鳠中检出,锰 (Mn) 仅在大鳍鳠中检出。研究表明,越鳠在蛋白质、粗脂肪、总糖、氨基酸总量及必需氨基酸指数方面均高于斑鳠和大鳍鳠。斑鳠在水分和多不饱和脂肪酸含量方面高于越鳠和大鳍鳠。
南方水产科学封面

中文名称:南方水产科学

杂志社官网:http://www.schinafish.cn

英文名称:South China Fisheries Science

语言:中文

类别:农业科学

主 编:张殿昌

创刊时间:1963

出版周期:双月

国内刊号:44-1683/S

国际刊号:2095-0780

出版地:广东

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