南方水产科学

作者：高进, 王永波, 刘金叶, 郭一兰, 符书源

关键词：豹纹鳃棘鲈, 差异流速, 转录组分析

水流速度是影响鱼类生长的重要环境因子之一。为探究豹纹鳃棘鲈 (Plectropomus leopardus) 在不同流速条件下相关基因的功能和表达情况，利用RNA-Seq技术对差异流速下的豹纹鳃棘鲈肝脏组织进行了转录组分析。挑选相同繁育批次中规格一致的豹纹鳃棘鲈幼苗，分别在正常流速 (0.1 m·s−1, Low flow velocity, LFV) 和高流速 (0.4 m·s−1, High flow velocity, HFV) 实验组中养殖150 d后进行肝脏转录组测序分析，探究豹纹鳃棘鲈在差异流速下个体间的基因表达模式差异。结果显示，经筛选后共获得1 977个LFV-HFV显著性差异表达基因 (Differentially expressed genes, DGE)，其中上调基因999个，下调基因978个。GO功能注释分类发现，共有1 124个DEGs被GO数据库注释到并归属为56个功能类别。KEGG富集分析结果显示，573个DEGs参与了154条KEGG通路，其中富集最显著的为PPAR信号通路。LFV和HFV两组鱼的肝脏组织学观察结果显示，两者之间脂肪含量差异明显，LFV组肝脏中的脂肪含量显著高于HFV组 (P<0.05)。通过转录组分析，筛选了大量豹纹鳃棘鲈差异流速下的DGEs，为深入探讨豹纹鳃棘鲈对流速变化适应性的分子调控机制提供了技术支撑。

来源：2022年第1期

《南方水产科学》期刊编辑部

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