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国内刊号：44-1683/S
国际刊号：2095-0780
发布日期:
作者：林枫, 贾若南, 王法祥, 许强华
关键词：斑马鱼, miRNAs, 高通量测序, 热休克蛋白基因, 靶基因预测
为研究microRNAs (miRNAs) 应对低氧胁迫的生物学功能，对低氧胁迫和常氧条件下斑马鱼 (Danio rerio) 鳃组织进行高通量miRNAs测序，分析了低氧胁迫与常氧条件下斑马鱼鳃中miRNAs的表达差异。结果表明，低氧胁迫和常氧条件下，斑马鱼鳃中共有15个miRNAs呈显著差异表达，其中13个miRNAs在低氧胁迫斑马鱼鳃中的表达量显著上调，2个miRNAs表达量显著下调。对miRNAs测序和斑马鱼鳃转录组进行关联分析，针对前期筛选获得的低氧胁迫与常氧条件下显著差异表达的28个热休克蛋白基因进行靶基因预测，结果显示，低氧胁迫下显著低表达的miR-455-3p同时靶向提高热休克蛋白基因hspa14和dnajb6b的表达，以增强对低氧的适应能力。另外，低氧胁迫下显著高表达的miR-194a和miR-155可以分别靶向5个热休克蛋白基因 (hspa12a, dnajc5aa, hspb7, hsp70.3, dnajb2) 和4个热休克蛋白基因 (hspa12a, hspg2, hspa13, dnajb2) 来调控斑马鱼对低氧环境的适应。
来源：2022年第3期
《南方水产科学》期刊编辑部
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