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国内刊号：44-1683/S
国际刊号：2095-0780
发布日期:
作者：伞利择, 刘宝锁, 张楠, 郭梁, 郭华阳, 朱克诚, 张殿昌
关键词：卵形鲳鲹, InDel, 重测序, 耐低氧性状
卵形鲳鲹 (Trachinotus ovatus) 是高耗氧率的鱼类，低氧极易导致其死亡。筛选其耐低氧性状InDel分子标记并挖掘影响耐低氧性状的功能基因，可为选育具有较强耐低氧能力的卵形鲳鲹提供有益指导。利用全基因组重测序技术分析了卵形鲳鲹基因InDel差异，挖掘卵形鲳鲹与耐低氧性状显著关联的InDel位点，并探讨了与耐低氧性状相关的候选基因。结果表明，测序共获得693.48 Gb数据，其中Q30的平均值为90.8%，注释分析发现了共2 574 178个InDel位点。敏感组50尾卵形鲳鲹所特有的InDel共249 395个，其中2 209个位于外显子上，在核苷酸切除修复信号通路和细胞黏着分子中存在变异基因。将InDel位点与耐低氧性状关联分析发现，3个InDel位点 (InDel 22883061、InDel 24919481和InDel 14451779) 接近显著性阈值，注释分析获得了9个候选基因。筛选到的InDel位点对后期分子标记选择育种的选择和鉴定有重要价值，注释到的候选基因为卵形鲳鲹耐低氧的机理研究提供了基础和依据。
来源：2022年第5期
《南方水产科学》期刊编辑部
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