南方水产科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:44-1683/S

国际刊号:2095-0780

南方水产科学杂志2022年第6期:基于转录组学技术对斑马鱼肝脏组织低氧胁迫影响的研究

发布日期:

作者:宋汝浩, 胡瑞芹, 李根芳, 张智聪, 许强华

关键词:斑马鱼, 转录组, 低氧胁迫, 肝脏, 铁代谢

为探究鱼类响应低氧胁迫的调控机制,将1月龄的野生型斑马鱼 (Danio rerio) 在1.5 mg·L−1的低氧浓度下胁迫2个月后,对其肝脏组织进行转录组测序比较分析。对常氧与低氧组的3 270个差异基因进行KEGG分析,主要富集于细胞增殖、脂质代谢、糖类代谢和氨基酸代谢等通路。其中,上调的1 864个基因主要与细胞增殖相关,下调的1 406个基因主要参与脂质代谢。对差异基因进行GO富集分析,发现铁离子束 (Iron ion banding) 功能差异显著。对铁代谢相关基因的表达量进行分析,发现铁离子储存相关基因fthl28和fthl31变化显著,提示在低氧胁迫下斑马鱼肝脏 (Zebrafish liver, ZFL) 组织中铁离子含量发生显著变化。利用ZFL细胞进行体外验证实验,将ZFL细胞进行0.1% (体积分数) O2低氧胁迫,发现随着胁迫时间的延长,ZFL细胞的成活率降低,且细胞中与铁代谢相关基因和铁蛋白 (Ferritin) 的表达均显著降低。综上所述,铁代谢调节是低氧胁迫下的重要响应过程,低氧会导致细胞内铁代谢紊乱,延长低氧时间会形成新的铁稳态。研究结果为探究鱼类的低氧适应机制提供了理论基础和参考。

来源:2022年第6期

《南方水产科学》期刊编辑部

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