南方水产科学

作者：罗慧, 方弟安, 何苗, 毛成诚, 匡箴, 祁洪芳, 徐东坡

关键词：青海湖裸鲤, 单核苷酸多态性, 基因分型技术, 遗传分化, 渔业资源

为探究青海湖裸鲤 (Gymnocypris przewalskii) 的种质资源现状，为该物种保护措施的制定提供参考依据。首次利用基因分型技术 (Genotyping-by-sequencing, GBS)，对青海湖水域的6个地理群体共72尾青海湖裸鲤进行单核苷酸多态性 (Single nucleotide polymorphism, SNP) 标记开发和遗传特征分析。共检测出1 600 061个SNP位点，质控后筛选出45 266个高质量的SNP位点用于遗传分析，发现核苷酸多样性 (Pi) 为0.317 0~0.327 4，观测杂合度 (Ho) 和期望杂合度 (He) 分别为0.459 4~0.482 3和0.336 7~0.344 4。6个地理群体的遗传距离 (D) 为0.018 4~0.023 3，两两群体的遗传分化系数 (Fst) 均不显著 (P>0.05)。分子方差分析 (Analysis of molecular variances, AMOVA) 显示102.37%的遗传变异来自群体内；群体遗传结构和系统发育进化树分析均显示6个群体属于一个集群，具有遗传同质性；而主成分判别分析 (Discriminant analysis of principal components, DAPC) 表明哈尔盖河、黑马河和沙柳河群体相互交叉聚类，其余3个地理群体分别聚类。综上，6个青海湖裸鲤群体的Ho均大于He，种群结构单一。

来源：2023年第1期

《南方水产科学》期刊编辑部

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