南方水产科学

作者：刘敏, 刘畅, 刘广锋, 朱鹏, 谢科明, 姜敬哲

关键词：香港牡蛎, 微病毒科, 生物信息学分析, 主要衣壳蛋白, 外部支架蛋白

具有滤食习性的牡蛎富集了水体中包括病毒在内的大量病原体，是一个极具价值的病毒库。为了对牡蛎相关的病毒库进行深入研究，在前期对华南沿海多地采集的香港牡蛎 (Crassostrea hongkongensis) 进行病毒组测序，并对测序数据进行质控、组装及物种注释后，挑选其中5条被鉴定为微病毒科 (Microviridae) 的基因组序列进行多维度分析，包括宿主预测、开放阅读框预测、主要衣壳蛋白系统发育与三维结构预测、主要衣壳蛋白与外部支架蛋白的进化关联以及病毒丰度分析等。结果显示，5个病毒的宿主均为埃希氏菌属 (Escherichia)；其中病毒基因组序列HSd1-5344568聚类在Bullavirinae分支中，说明其为该亚科成员；其余4条未聚类到任何已知亚科中，应属于一个单独的未分类亚科；微病毒主要衣壳蛋白和外部支架蛋白的进化树之间的联系表明两个蛋白的进化规律不同。

来源：2023年第5期

《南方水产科学》期刊编辑部

查看南方水产科学杂志2023年第5期