南方水产科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:44-1683/S

国际刊号:2095-0780

南方水产科学杂志2024年第2期:牙鲆mstn基因SNPs位点多态性与生长性状的关联分析

发布日期:

作者:李兵部, 王桂兴, 张晓彦, 刘玉峰, 何忠伟, 曹巍, 任建功, 任玉芹, 张祎桐, 伞利择, 王玉芬, 侯吉伦

关键词:牙鲆, 肌肉生长抑制基因, 单核苷酸多态性, 生长性状

为研究牙鲆 (Paralichthys olivaceus) 肌肉生长抑制基因 (mstn) 多态性,开发其分子辅助育种新标记,采用重测序方法对120尾牙鲆 (3个双克隆杂交家系:60 尾;3个雌核发育家系:60 尾) 的mstn基因进行单核苷酸多态性 (Single nucleotide polymorphism, SNP) 位点筛选,并对不同基因型个体的生长性状进行多重比较及SNP标记验证。结果显示,共检测到7个SNPs位点,均为颠换型突变;外显子区3个 (Exonl 1: G2063A; Exonl 3: C3883T, C4009A),为同义突变;内含子区3个 (Intron 1: A2444T; Intron 2: T3816C, A3832C);3'端非编码区1个 (3'UTR: C4564A)。SNPs与生长性状关联分析结果表明,A3832C和C4564A标记位点与牙鲆体质量、体长、体高等生长性状显著相关 (P<0.05),其中A3832C 位点AA基因型和C4564A位点AC基因型在生长上表现出优势,A3832C位点CC和C4564A位点AA、CC基因型在生长上表现出劣势,其他5个SNPs位点对牙鲆生长性状影响不显著 (P>0.05)。将A3832C和C4564A标记位点在牙鲆生长快速群体 (F: 60 尾) 和生长缓慢群体 (S: 60 尾) 中验证,验证结果与多重比对结果一致,表明2个SNPs位点具有较高的稳定性。综上所述,研究筛选出了牙鲆mstn基因中与生长性状显著相关的A3832C和C4564A两个标记位点,为牙鲆分子辅助育种提供了理论参考。

来源:2024年第2期

《南方水产科学》期刊编辑部

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