南方水产科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:44-1683/S

国际刊号:2095-0780

南方水产科学杂志2025年第2期:基于recA基因的qPCR与RAA-LFD检测鳗败血假单胞菌方法的建立与应用

发布日期:

作者:王一霖, 艾明齐, 蒋奇滨, 彭焜, 周柯宇, 樊威, 欧阳萍, 陈德芳, 黄小丽, 耿毅

关键词:鳗败血假单胞菌, 大口黑鲈, SYBR Green I real-time quantitative PCR, RAA-LFD, 菌体载量

为实现鳗败血假单胞菌 (Pseudomonas anguilliseptica, PA) 早期感染的快速诊断,基于recA基因建立了2种检测方法:SYBR Green I实时荧光定量PCR (SYBR Green I real-time quantitative PCR) 和重组酶介导等温扩增结合侧流层析试纸条 (Recombinase-mediated isothermal amplification combined with lateral flow dipstick, RAA-LFD)。以PA的管家基因recA为靶标,设计筛选出1对qPCR特异性引物、1对RAA特异性引物和RAA探针,并通过同源重组构建标准品质粒pUC18-recA,以建立2种检测方法。将所建立的方法应用于PA感染的大口黑鲈 (Micropterus salmoides) 组织样本检测,并测定PA载量。结果表明,建立的qPCR方法最低DNA检测浓度为2.816×102 拷贝·μL−1,模板量与Ct值在构建的标准曲线中呈现良好的线性关系 (r2=0.999 2),且具有较强的特异性和较高的稳定性;RAA-LFD方法的最低DNA检测浓度为2.816×104 拷贝·μL−1,检测时间最快可达15 min,显色较为稳定且特异性强。应用结果显示,qPCR和RAA-LFD方法的阳性样本检出率分别为87.50%和85.00%,较普通PCR方法明显提高;其中,qPCR方法可准确测定PA感染宿主组织中的菌体载量,肾中的载量最高,达3.533×107 拷贝·ng−1。建立的2种方法特异性均较好,其中qPCR方法灵敏性更高,RAA-LFD方法则时效性更强,均可用于PA早期感染的检测,且qPCR方法还可对感染宿主体内的菌体载量进行定量分析。

来源:2025年第2期

《南方水产科学》期刊编辑部

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