国内刊号:44-1683/S
国际刊号:2095-0780
发布日期:
作者:曹柳, 马军, 卢艳, 武雅彤, 王钧, 钟立静, 苏珊珊, 黄海
关键词:杉虎杂交斑, 肌球蛋白重链基因, 生长性状, 单核苷酸多态性位点
肌球蛋白重链 (Myosin heavy chain) 参与鱼类肌纤维肥大和增生过程,在肌肉生长和收缩过程中扮演重要角色。为筛选出与生长性状相关的单核苷酸多态性 (Single nucleotide polymorphisms, SNPs) 位点,采用PCR扩增技术获得海水经济养殖鱼类——杉虎杂交斑 (棕点石斑鱼Epinephelus fuscoguttatus ♀ × 清水石斑鱼E. polyphekadion ♂) 的肌球蛋白重链基因序列全长,并基于相关性分析筛选与生长性状相关的SNPs位点。结果表明,杉虎杂交斑肌球蛋白重链基因序列全长为12 129 bp,包含36个外显子和35个内含子,可编码1 934个氨基酸。该基因包含4种类型的蛋白结构域:Myosin_N、MYSc、IQ和Myosin_tail_1。经比对分析发现,该基因的核苷酸序列及蛋白结构域在鲈形目、鲀形目和鲽形目鱼类中均表现出较高的保守性。在肌球蛋白重链基因中检测到62个SNPs位点,其中8个符合Hardy-Weinberg平衡。有12个SNPs位点位于外显子区域,且均与体质量、全长等多个生长表型性状显著相关 (p<0.05)。在这12个SNPs位点中仅有g5417 C>G为错义突变,导致丙氨酸变成甘氨酸;其余位点均为同义突变。这些与生长相关的SNPs位点可作为杉虎杂交斑生长分子标记开发的候选位点。
来源:2025年第4期
《南方水产科学》期刊编辑部