南方水产科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:44-1683/S

国际刊号:2095-0780

南方水产科学杂志2026年第3期:似刺鳊鮈基因组中微卫星分布特征及群体遗传结构分析

发布日期:

作者:丁立云, 尤连祥, 肖俊, 那荣滨, 龙凡, 刘天奇, 巫伟华, 郑先虎, 鲁翠云

关键词:似刺鳊鮈, 基因组, 微卫星标记, 遗传结构

为开发似刺鳊鮈 (Paracanthobrama guichenoti) 的共显性、多态微卫星标记,并对其自然群体开展遗传监测,以支持该物种的种质资源保护与可持续利用。本研究分析了似刺鳊鮈基因组中微卫星 (2~6个核苷酸重复) 的分布特征,筛选出多态性微卫星标记,对长江中、下游3个重要湖泊 (八里湖、军山湖和大官湖) 的似刺鳊鮈种群进行了遗传评估。结果显示,从基因组中共检测到771 961个完美型微卫星序列,二核苷酸重复微卫星最多 (67.3%),其次为四核苷酸重复 (22.5%);筛选的23个多态性微卫星标记,共检测到213个等位基因,多态信息含量 (PIC) 为0.661~0.919,均为高度多态标记 (PIC≥0.5),群体平均等位基因数 (Na) 为5.913~8.565,观测杂合度 (Ho) 为0.448~0.819,PIC为0.579~0.786,3个群体均处于高度多态水平 (PIC≥0.5),表明长江中下游湖区似刺鳊鮈群体具有较高的遗传多样性水平。分子方差分析 (AMOVA) 结果显示88.2%的遗传分化来源于群体内,11.8%的遗传变异来源于群体间,群体间具有中度遗传分化 (0.05<Fst=0.118<0.15),八里湖和军山湖群体间基因交流频繁 (Nm=5.985>4),两群体与大官湖群体的遗传分化达到中、高度水平 (0.05<Fst<0.25),推测江湖连通性引起的建群者效应差异是群体遗传多样性和遗传分化的关键。

来源:2026年第3期

《南方水产科学》期刊编辑部

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